Trabalhando em rede

O Comitê Gestor do INCT Herbário Virtual da Flora e dos Fungos no dia 15 de abril pp, lançou um convite a todos os especialistas para participarem de uma ação conjunta em comemoração ao Dia Nacional da Botânica. Essa atividade tem por objetivo identificar amostras herborizadas de plantas, algas e fungos que estão online com imagens. As novas identificações foram incluídas nos comentários de cada registro e encaminhadas aos curadores dos acervos. Cada comentário é registrado no sistema e dessa forma permite analisar a evolução numérica dessa ferramenta.

Resultados parciais do dia 21 de abril às 14:25 indicam uma participação sem precedentes nessa ação. Vamos aos números.

O primeiro gráfico apresenta o número de comentários enviados por ano, desde o lançamento dessa ferramenta em 2012.

Números ainda não consolidados para o mês de abril já indicam para o ano de 2020, praticamente o dobro dos comentários dos anos passados.

Analisando a evolução do número de comentários nos meses de 2020 temos:

Estávamos mantendo uma média mensal em torno de 50 comentários. O mês de abril já apresenta um número 23 vezes superior. 

Por fim, avaliando a evolução do número de comentários por dia, o mês de abril apresenta o seguinte quadro:

Esse gráfico demonstra o impacto do convite feito pelo Comitê Gestor do INCT-Herbário Virtual à comunidade botânica. Comunidade esta que há décadas se organiza através da Sociedade Botânica do Brasil e que teve, na organização do INCT-Herbário Virtual a oportunidade de compartilhar seus dados e conhecimentos online.

No início de maio apresentaremos os dados consolidados do mês de abril. Os números já demonstram a força do trabalho em rede que, além dos mais de mil registros com identificações dos espécimes, promoveu mudanças na ferramenta Comentários em atendimento às demandas dos especialistas.

Ações do INCT-Herbário Virtual no Dia da Botânica

Herbários Brasileiros participantes do Herbário Virtual online

O dia 17 de abril é o “Dia da Botânica” no Brasil. Para comemorar esta data, o INCT-Herbário Virtual da Flora e dos Fungos (INCT-HV) convida os especialistas para participarem de uma ação conjunta para identificar amostras herborizadas, sem identificação, de plantas, algas e fungos que estão online.

O INCT-HVFF integra 220 conjuntos de dados compartilhados por mais de uma centena de instituições do país e 23 do exterior. São cerca de 7,7 milhões de registros, todos de acesso livre e aberto a qualquer pessoa interessada. Cerca de 2,8 milhões de registros têm uma imagem da amostra associada ao registro.

No momento, nessa base de dados existem muitos registros de exsicatas, com imagens, não identificados. Se consultarmos o conjunto de dados com imagens de coletas realizadas no Brasil, vamos encontrar: 

MCCA 1721

• 5.633 registros com os campos família e nome científico em branco;

• 52.849 registros com o campo família preenchido e os campos gênero e espécie em branco; e, 

• 217.058 registros com os campos família e gênero preenchidos e o nome da espécie em branco.

Trata-se de um volume bastante expressivo que poderia ser reduzido com um olhar cuidadoso de taxonomistas, promovendo, quando possível, identificações a partir das imagens, das famílias, gêneros e/ou espécies.

Cada especialista pode fazer uma busca no Herbário Virtual no speciesLink, por família ou gênero que queira revisar e filtrar aqueles que têm imagens. Pode-se filtrar também por país, pois agora temos também registros de outros países da América do Sul, ou por Unidade da Federação. Se for feita alguma identificação, é possível enviar um e-mail diretamente ao curador da coleção onde está depositado o espécime, através do aplicativo “comentário”, presente ao clicar no registro. Estes comentários podem ser conferidos pelo curador e, se este achar pertinente, poderá incluir a informação no banco de dados do seu herbário e atualizar os dados na rede speciesLink.

Um tutorial sobre como buscar material não identificado no Herbário Virtual e enviar seus comentários está disponível no Canal YouTube da rede speciesLink.

Sabemos que alguns especialistas já estão usando uma parte do seu tempo de trabalho em casa nesta atividade. Gostaríamos de agregar mais taxonomistas nos próximos dias para que esta atividade de comemoração do Dia da Botânica represente um ganho qualitativo no estudo da nossa flora. Se cada um enviar este convite aos seus parceiros de trabalho, equipe do herbário e estudantes, esta ação certamente será ampliada.

Torcemos para que, o mais breve possível, possamos voltar a nos encontrar e trabalhar com os nossos acervos presencialmente. 

Comitê Gestor do INCT – Herbário Virtual

Estudo Taxonômico e Filogenético de Rhynchospora (Cyperaceae) complexo Tenuis

Hoje divulgamos o resumo para divulgação apresentado pelo bolsista pós-doc do INCT-Herbário Virtual Pedro Joel Silva da Silva Filho que trabalhou na UFRGS de agosto a dezembro de 2019.

A bolsa de Estágio Pós-Doutoral INCT - Herbário Virtual foi muito importante por dar continuidade aos estudos em Rhynchospora que venho desenvolvendo desde meu doutorado. Durante o período foram analisadas minunciosamente mais de 300 exsicatas de espécies/morfotipos pertencentes ao clado que envolve a espécie R. tenuis, selecionadas de diversos herbários do Brasil e do exterior. Estes espécimes foram comparados com as descrições e tipos de mais de 20 nomes relacionados ao clado de R. tenuis, sendo os espécimes não identificados agrupados em morfotipos, e posteriormente descritos. Com os morfotipos descritos, estamos dando continuidade às análises moleculares para validação de novas espécies. Após a aprovação deste projeto, me surgiu a possibilidade de trabalhar com Sequenciamento de Nova Geração (NGS), mais especificamente com a técnica de NextRAD (Nextera-tagmented reductively-amplified DNA). Integrando a taxonomia clássica às análises filogenômica que estamos desenvolvendo, pretendemos ainda montar artigos robustos que serão submetidos a revistas de alto impacto, respondendo questões ainda não contempladas com as análises que foram até o momento desenvolvidas. Durante os cinco meses de vigência da bolsa, foram publicados dois artigos científicos descrevendo três novas espécies de Rhynchospora. Um artigo sobre a filogenia (marcadores ETS, ITS e trnL-F) de Rhynchospora seção Tenues também foi submetido e se encontra sob avaliação. Cabe ainda citar constante atualização das informações de Rhynchospora na Flora do Brasil 2020, que totaliza mais de 150 espécies;  correção de exsicatas de diversos herbários brasileiros, disponibilizando informação atualizada para os sistemas online; e colaboração em outros artigos relacionados ao tema.