25 de ago. de 2022

Mais um artigo sobre a experiência do INCT-Herbário Virtual da Flora e dos Fungos

 Dora Ann Lange Canhos

A equipe responsável pela coordenação do Herbário Virtual da Flora e dos Fungos, um dos Institutos Nacionais de Ciência e Tecnologia, liderada nesta publicação pela Maria Regina de V. Barbosa, publicou o resumo do trabalho preparado para o simpósio "A Global Collections Network: building capacity and developing community" promovido pelo TDWG 2022 na Bulgária.

O título do trabalho é:
"Building Networks to Promote Knowledge of Brazil’s Biodiversity: The experience of the INCT - Virtual Herbarium"

com autoria de: 

Maria Regina de V. Barbosa, Ana Odete Vieira, Ariane L Peixoto, Dora Ann Lange Canhos, João R Stehmann, Mariângela Menezes e Leonor C Maia.

O trabalho foi publicado no: Biodiversity Information Science and Standards 6: e91462. https://doi.org/10.3897/biss.6.91462.

Boa Leitura!

Para quem ainda não assistiu, o INCT também apresenta um novo vídeo sobre 
"Boas práticas na produção de imagens" 

oferecido pela:

  • professora Maria Candida Henrique Mamede, curadora do Herbário do Estado "Maria Eneyda P. Kaufmann Fidalgo" do Instituto de Botânica de São Paulo, 
  • com a produção e edição de Caio Herique Mamede.

Boa Aula!



20 de ago. de 2022

São Paulo School of Advanced Science on Sustainable and Inclusive Amazon (SPSAS)

 Carlos A. Joly

The objective of this SPSAS is to provide young post-docs with a multi and interdisciplinary vision, including the vision of indigenous and traditional populations, of the main problems that have historically hindered sustainable development, conservation, and social inclusion in the Amazon Basin, as well as to discuss the existing alternatives and jointly build new proposals for the solutions to these problems.

The SPSAS Sustainable and Inclusive Amazon will take place from November 21th to December 4th in a Hotel/Resort in the countryside of the State of São Paulo, that allows isolation from the urban and day-to-day hustle, promoting a greater focus and strong interaction between all participants.

The course will be based on lectures, discussions, work groups, and the development of a draft paper with a problem-solving perspective, where groups of students will be challenged to create scenarios for a certain issue/situation, to be defined by each group, or offered by the teachers. Through this challenge, students should develop possible scenarios/visions, indicate what data is required, and what models are available or need to be developed to test the scenarios. Participants will interact with renowned scientists, seeking the solution to the challenges presented in a multidisciplinary and multicultural context.

The program will be divided into 3 main axes:

Axis 1 - The Amazonian territory and its sustainability

Axis 2 - Amazonians as protagonists of biodiversity conservation and climate change mitigation

Axis 3 - The Amazon and its inhabitants in harmony with its environment and the Sustainable Development Goals (SDG)

Who can apply: SPSAS Amazon is for early career researchers that have earned his/her PhD from 2015 onward. Exceptionally PhD candidates (graduate students, currently registered in the last year of their Doctoral/PhD courses), can also be accepted. We encourage applications from students from different academic disciplines (natural, social, and human sciences, engineering, communication) provided their academic work and study is related to the themes of the school and related topics.

Application deadline: August 31th, 12:00 (GTM-03)

To promote the diversity of the School’s participants, equity in ethnic and gender representation will also be considered.

Expected number of students: 90

  • 15 From the Brazilian Amazon Post Docs/Doctoral candidates who did their undergraduate studies in the Amazon Region.
  • 15 Post Docs/PhD from AMAZONIA COUNTRIES (Bolivia, Colombia, Ecuador, Guyana, French Guyana, Peru, Suriname and Venezuela). 
  • 15 Post Docs/Doctoral Fellows from OTHER REGIONS OF BRAZIL 
  • 30 Post Docs from Institutions from the state of São Paulo (usually FAPESP requires 50% from São Paulo Institutions)
  • 15 Post Docs from OTHER COUNTRIES. 

More information including the full program and how to apply is available at https://spsas-amazonia.biota.org.br/.


19 de ago. de 2022

Novo filtro por uso e cobertura da terra no speciesLink

Renato De Giovanni

Como produto da parceria CRIA/MapBiomas, patrocinada pelo Instituto Clima e Sociedade (iCS), a rede speciesLink oferece uma nova possibilidade de filtragem em sua interface de busca com base no uso e cobertura da terra. Os dados são provenientes do MapBiomas, uma iniciativa pioneira que desde 2015 vem produzindo mapas anuais da cobertura e uso da terra no Brasil através de uma rede colaborativa de ONGs, universidades e startups de tecnologia.

Nesta versão inicial, é possível filtrar os registros disponíveis na rede speciesLink por categoria de uso e cobertura da terra nos anos 1985 e/ou 2020 da coleção 6 do MapBiomas. Apenas registros coletados no Brasil e georreferenciados na origem são considerados. As categorias disponíveis para filtragem são as mesmas da legenda do MapBiomas, que estão divididas em dois grandes grupos: áreas naturais, com subcategorias como formação florestal, formação savânica, rios, lagos, mangue, entre outros, e áreas antropizadas, com subcategorias como pastagem, mineração, agricultura, etc. É possível utilizar dois filtros simultâneos, permitindo buscas, por exemplo, por registros coletados em locais onde em 1985 havia cobertura natural mas que em 2020 o mesmo local encontra-se antropizado.

Novo filtro por uso e cobertura da terra.

A visualização dos resultados em mapa agora oferece também a possibilidade de ativar camadas de sobreposição relativas ao uso e cobertura da terra, permitindo selecionar o ano e as categorias desejadas. Registros do speciesLink coletados no Brasil e georreferenciados na origem agora incluem informações sobre as categorias de uso e cobertura da terra.

Novas camadas de sobreposição com base no uso e cobertura da terra.

Nas próximas versões os dados do MapBiomas na rede speciesLink deverão ser atualizados para a nova coleção 7, a ser lançada no final de agosto de 2022. Também serão incorporados os mapas de todos os anos intermediários. Além disso, em breve, os dados da rede speciesLink também estarão disponíveis através da interface do MapBiomas.

Tratando-se de uma versão inicial, ideias e sugestões são sempre bem-vindas! Esperamos, com esta nova funcionalidade, estimular novas pesquisas e diferentes tipos de busca unindo dados de biodiversidade a dados de uso e cobertura da terra.

17 de ago. de 2022

Artigo sobre a rede speciesLink

Dora Ann Lange Canhos


Em outubro de 2021 recebemos o convite do Prof. Carlos A. Joly, coordenador do programa Biota-Fapesp, para escrever um artigo sobre a rede speciesLink para um volume especial da revista Biota Neotropica, em comemoração aos 60 anos da Fapesp. 

Membros da equipe do CRIA participaram do grupo responsável pela formulação da proposta do programa Biota para a Fapesp entre 1996 a 1999. No início do programa, fomos responsáveis pelo desenvolvimento da primeira versão do SinBiota e da revista Biota Neotropica. Assim, foi com muito entusiasmo que recebemos esse convite para escrever sobre a rede speciesLink, cujo desenvolvimento teve início em 2001, graças ao apoio da Fapesp.

Como o próprio nome indica, a rede speciesLink é uma rede de provedores de dados, usuários e de vários colaboradores no Brasil e no exterior. Queríamos que o artigo refletisse esse trabalho em rede. Portanto, para escrever sobre o speciesLink foi criada uma “rede” de autores do Brasil e do exterior.

O artigo está disponível online: Biota Neotropica, Volume 22, Issue: spe, Published: 2022: 


Aproveito a oportunidade para agradecer a todos os provedores de dados que disponibilizam seus dados, informações e conhecimento de acesso livre e aberto e a todos os usuários que contribuem para o avanço da rede com suas críticas, sugestões e conhecimento. Por fim, agradeço cada autor desse trabalho, sem os quais esse resultado não seria alcançado. Os autores apresentados em ordem alfabética são:
  • A. Townsend Peterson, University of Kansas, Lawrence, Kansas, USA.
  • Ana Lucia Assad, Associação Brasileira de Estudos das Abelhas, São Paulo, SP, Brasil.
  • Arthur David Chapman, Australian Biodiversity Information Services, Melbourne, Australia.
  • Barbara Thiers, New York Botanical Garden, Bronx, New York, USA.
  • Dora Ann Lange Canhos, CRIA, Campinas, SP, Brasil
  • Eduardo A. B. Almeida, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, SP, Brasil.
  • Gil Nelson, Integrated Digitized Biocollections, Gainesville, Florida, USA.
  • João Renato Stehmann, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brasil.
  • José Rubens Pirani, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brasil.
  • Joseph T. Miller, Global Biodiversity Information Facility, Copenhagen, Denmark.
  • Leonor Costa Maia, Universidade Federal de Pernambuco, Recife, PE, Brasil.
  • Lúcia Garcez Lohmann, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brasil.
  • Mercedes Maria da Cunha Bustamante, UnB, Brasília, DF, Brasil.
  • Renato De Giovanni, CRIA, Campinas, SP, Brasil.
  • Sidnei de Souza, CRIA, Campinas, SP, Brasil.
  • Vanderlei Perez Canhos, CRIA, Campinas, SP, Brasil.
  • Vera Lúcia Imperatriz-Fonseca, Universidade de São Paulo, SP, Brasil.

Boa leitura!