Após o evento Google for Brasil 2022, o CRIA participou de uma coletiva de imprensa com a equipe do Google e o jornalista Marcelo Gimenes Vieira do itforum. Vejam a publicação resultante de Marcelo Gimenes Vieira:
Com Google Cloud, Cria quer expandir uso de dados sobre biodiversidade
Migração de sistemas e dados do Centro de Referência em Informação Ambiental para a nuvem abre perspectivas para além da academia
Boa leitura!
O CRIA foi convidado a participar do Google for Brasil, o principal evento anual do Google no país, realizado no dia 14 de junho. No evento foram apresentadas várias novas ações e desenvolvimentos do Google com parceiros no país, em busca de um Brasil mais inclusivo, socialmente justo e economicamente sustentável. Entre as ações, foi apresentada por Maia Mau, Head de marketing de produtos do Google para a América Latina e co-líder do comitê interno de sustentabilidade, a parceria com o CRIA para a manutenção de seus sistemas públicos de informação online através do Google Cloud Brasil. Acreditamos ser esse um momento de grande alegria para todos nós por representar um grande passo rumo à preservação da rede colaborativa que nos une, a rede speciesLink, e dos demais sistemas públicos de dados.
Vale à pena conferir o post publicado pela Maia Mau no blog do Google e o Blog do Google Brasil com todas as novas iniciativas apresentadas no evento.
Diante do declínio acentuado do país, as Organizações da Sociedade Civil tornam-se atores ainda mais estratégicos para a retomada do desenvolvimento. Entretanto, o tema dificilmente tem o destaque necessário no debate público. "Quando cumpre seu papel, mantendo-se distinto tanto do Estado quanto da iniciativa privada, combinando a vocação e a missão públicas do primeiro com a flexibilidade focada em resultados do segundo, o Terceiro Setor não combina com as visões de mundo e os discursos da direita privatista e da esquerda estatizante, que ainda dominam o debate político", explica Rubens Naves.
Dora Ann Lange Canhos em nome da equipe do CRIA
Realizada com o apoio da Finep e Conselho Britânico, a visita da Barbara Kirsop ao Brasil em 1986, resultou na estruturação de um programa de capacitação de recursos humanos para a organização, gerenciamento e informatização de coleções microbiológicas. Ao longo de uma década foram oferecidos cerca de 50 cursos de treinamento e eventos internacionais abertos a curadores e técnicos de coleções microbiológicas do país. Vanderlei Canhos foi eleito secretário e vice-presidente da WFCC nas gestões de Barbara Kirsop, sendo depois eleito presidente. Tudo isso fomentou a articulação internacional e contribuiu para que a Coleção de Culturas Tropical, CCT, se tornasse uma Coleção de Serviços de reconhecimento internacional.
Em 1985, a Base de Dados Tropical, BDT, publicou o primeiro Catálogo Nacional de Linhagens online através do serviço Cirandão da Embratel. Em 1988 se tornou ponto focal do MSDN (Microbial Strain Data Network) e em 1993 desenvolveu o sistema Bioline International, uma proposta da Barbara apresentada à equipe. A colaboração da Barbara com editores de revistas científicas internacionais resultou na estruturação de um sistema de informação integrador para disseminação on-line dos resumos de artigos publicados em periódicos científicos no Bioline de forma livre e aberta a todos. Aos poucos, essa ideia inicial foi mudando e o interesse do Bioline, ou seja, da Barbara, passou a ser o de disponibilizar a plataforma Bioline para que os países do hemisfério sul pudessem divulgar a sua ciência, publicando artigos de interesse para os seus países nas suas revistas locais.
No processo ela também trouxe o Dr. Leslie Chan da Universidade de Toronto para trabalhar nessa iniciativa junto com a sua equipe. Enquanto o CRIA é responsável por manter e desenvolver o sistema, a Universidade de Toronto é responsável pelo gerenciamento do conteúdo.
Em 2021 foram requisitados em média 1,3 milhão de artigos completos por mês. Alguns indicadores do conteúdo são:
Número de artigos por país (Bioline, Jan, 2022)
Em 2013 Barbara esteve no Brasil, no CRIA juntamente com o Dr. Leslie Chan da Universidade de Toronto, nosso parceiro no Bioline, para celebrar os 20 anos dessa iniciativa.
Para a celebração dos 20 anos do Bioline, a Barbara, sempre muito ativa, fez um levantamento junto aos editores das revistas participantes e constatou o seu impacto e importância. Alguns depoimentos foram registrados e estão no vídeo do evento que conta um pouco da história do Bioline e da homenagem à Barbara que gostaríamos de compartilhar no nosso Blog para que todos possam se recordar dela ou conhecer um pouco da sua história.
https://www.youtube.com/watch?v=8OhdZFZ9x0w
Barbara Kirsop uma verdadeira cidadã do mundo a quem devemos muito.
Aproveitamos o último post do ano para agradecer a todos os colaboradores e financiadores pela confiança e dedicação no compartilhamento de dados e conhecimento via rede, de forma aberta e livre.
2021 foi um ano
muito complexo para o CRIA, que teve sua terceira grande transferência de todos os
seus sistemas para outro centro de dados. A primeira ocorreu em 2013, quando os
equipamentos do CRIA, em Campinas, foram fisicamente transferidos para o
Internet Data Center da RNP em Brasília. Ganhamos muito com essa transferência,
um ambiente mais seguro com infraestrutura profissional, incluindo excelente conectividade,
além do fortalecimento da parceria com a RNP que também proporcionou a integração
do CRIA à Redecomep em Campinas.
A segunda, em 2019,
envolveu a transferência dos sistemas do IDC/RNP de Brasília para uma nova
plataforma, o Centro de Dados Compartilhados da RNP (CDC/RNP) em Recife. O
motivo foi a obsolescência dos nossos equipamentos e, com essa transferência,
passamos a contar com os serviços em nuvem da RNP. Novamente o ganho foi grande,
uma infraestrutura compatível com as nossas necessidades e uma despreocupação
em relação à infraestrutura física necessária para manter nossos sistemas
online.
Em setembro de 2020
fomos informados pela RNP da impossibilidade de manter os serviços do CDC por
questões orçamentárias. Assim, em 2021 todos os sistemas foram transferidos
para o Google Cloud Platform (CGP),
dessa vez, numa mudança muito mais complexa por envolver a reestruturação de toda
a infraestrutura do CRIA. Isso foi possível por termos recebido um crédito
emergencial do Google para garantir que o sistema fosse mantido online enquanto
buscamos uma solução mais perene. Portanto, além da transferência propriamente
dita, nos preocupamos pela otimização do uso dos recursos para que o crédito concedido
dure mais tempo. Novamente ganhamos muito nesse processo. Os grandes
destaques são as parcerias com o Google e o MapBiomas, e o desenvolvimento do
novo speciesLink, lembrando que a
parceria com a RNP continua sendo fundamental.
Em relação ao novo speciesLink, gostaríamos de agradecer também
às mais de 200 pessoas que responderam ao questionário lançado online em 2020
com o objetivo de receber um feedback
com críticas e sugestões sobre o sistema. Acreditamos que a maior parte das
sugestões foram atendidas no novo speciesLink
cuja nova interface de busca foi lançada em agosto de 2021, mas continua em
franco desenvolvimento. Outros componentes da rede serão lançados em 2022.
Com o uso de novas ferramentas, o sistema de busca ficou
muito mais rápido, o que possibilitou a inclusão de filtros geográficos e
diferentes formas de visualizar o resultado da busca. Com isso, o uso dos
dados, que apresentava uma média de 680 milhões de registros por ano (1,9
milhão por dia), em 2021 apresenta um uso superior a 71 bilhões de registros, o
que representa uma média de 195 milhões de registros por dia. A rede hoje
disponibiliza 15,7 milhões de registros, portanto o sistema serve mais de 12
vezes o seu acervo por dia.
O número de imagens visualizadas praticamente dobrou, de 3,4
milhões de imagens em 2020 para 6,8 milhões, o que representa cerca de 19 mil
imagens visualizadas por dia.
2022 certamente também será um ano desafiador para todos nós,
mas acreditamos que a base construída através do trabalho colaborativo e em
rede prosperará.
Desejamos um ótimo 2022 para todos!
Equipe do CRIA
O Herbário Fernando Cardoso da Silva-HFC situa-se na base física da Embrapa Florestas, na zona suburbana, quase rural de Colombo-PR. Sua primeira coleta é de 1978 e sua trajetória foi lenta e irregular, melhorando nos últimos dez anos. Hoje, a estrutura física é adequada, contando com prédio próprio e um sistema automatizado de climatização simples e eficiente (≤ 18°C e ≤ 50% UR). O acervo soma 10.608 exsicatas, cujos dados estão inseridos em um banco do programa BRAHMS. A equipe é reduzida e experiente, embora não conte com profissionais formalmente instruídos em botânica. As determinações mais complexas têm sido feitas por pessoas externas, destacando-se o corpo técnico do herbário MBM de Curitiba-PR.
O banco de dados do HFC foi incorporado ao speciesLink em setembro de 2021. Não há imagens de exsicatas, pois o HFC não dispõe de mesa fotográfica apropriada. Todavia, imagens constituem um objetivo importante do HFC, seja para auxiliar na identificação, seja para fins didáticos em palestras ou cursos junto ao público leigo. Por isso, como norma de procedimento nos últimos anos, nas coletas botânicas realizadas pela equipe do HFC as plantas vivas ou frescas são fotografadas, originando uma fototeca dentro do BRAHMS ora abrangendo c.450 registros. Tais imagens (três por registro, em média) devem integrar o speciesLink em novembro de 2021.
O objetivo principal do HFC é assessorar a pesquisa florestal da Embrapa Florestas e seus parceiros, voltada à produção sustentável e à restauração de ecossistemas. Assim, tanto a flora nativa como espécies comerciais introduzidas ou asselvajadas são objetos de interesse. Para coletas, há ênfase no sul do Brasil, por aspectos financeiro e de conexão com os projetos em andamento.
A Xiloteca tem como principal objetivo apoiar estudos científicos em madeiras. É fonte importante de informações para a pesquisa, fornecendo possibilidades de identificação e resgate de dados sobre procedência, coletores, local onde estão depositadas as exsicatas e outras informações que auxiliam em estudos.
Sendo a madeira um material heterogêneo, constituído por células organizadas em diferentes direções, o melhor meio de se entender a sua estrutura é através de imagens das suas três secções: transversal, longitudinal tangencial e longitudinal radial. Desta forma, podemos visualizar as mesmas células em diferentes posições.
Estamos alimentando o banco de imagens das amostras da Xiloteca “Profa Dra Maria Aparecida Mourão Brasil” (BOTUw) e esperamos que isso contribua não apenas aos estudiosos da madeira, mas também para aproximar o público em geral a esse universo fantástico que é a madeira.
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| Registro online da amostra BOTUw 1322 da Xiloteca "Profa. Dra. Maria Aparecida Mourão Brasil" |
Para acessar todas as imagens disponíveis da xiloteca BOTUw é só acessar a interface de busca da rede speciesLink e digitar o acrônimo BOTUw.
Os temas discutidos foram:
· Inovações:
Estratégia e Coordenação. Nesse tema foram apresentados trabalhos de
produção de imagens 3D, digitalização de grandes coleções de insetos, entre
outros.
· Comunidade.
Alguns trabalhos nesse tema foram a mobilização de coleções paleontológicas nos
Estados Unidos, exemplos de Crowdsourcing,
WeDigBio, automação e mobilização de dados para pequenas coleções regionais, o
sistema distribuído Europeu de coleções e a colaboração regional na América do
Sul e Caribe do GBIF.
· Coleções
de História Natural e os Grandes Desafios. As apresentações incluíram: Porque
precisamos de digitação, machine learning,
inteligência artificial em um momento de mudança global; Conectando coleções de
história natural e genômica; Como coleções podem contribuir na pandemia; Valoração
de dados digitais de coleções; Digitalização de coleções nos EUA nos últimos 10
anos; e, Estratégias de limpeza de dados do speciesLink.
· What’s
next? Para discutir esse tema, as apresentações incluíram: O Mecanismo Coordenador
para a Gestão da Informação sobre Biodiversidade na África: Fortalecimento da
Ciência, Tecnologia e Inovação; Inovação com participação; Novos fatores que
impulsionam a digitalização no Museu de História Natural; Manejo de abelhas: estabelecimento
da primeira coleção de referência de Abelhas da África Ocidental; Paleo, µCT, canais
de aprendizado profundo e aplicações de pesquisa; Uso automatizado de espécimes
digitalizados na botânica; Coleções biológicas como infraestrutura de pesquisa
e desenvolvimento; Saltando de espécimes e amostras do projeto NEON em uma teia
de dados vinculados; A comunidade falou: agora, como podemos traduzir palavras
em ações?
O evento foi muito bem organizado e todas as apresentações e discussões foram gravadas. Também foram previamente preparados resumos e gravações individuais de cada apresentação. Recomendo o acesso ao wiki da conferência.
